VFRでは、VTR1000F同様エンジンのフロント部両側に各々一つラジエーターをマウントするデュアルラジエーターシステムを採用しています。このシステムを採用することで、従来避けられなかったフロントホイールの後方のエアフローの乱れによるラジエーターの冷却効率の低下を防ぎ、確実な冷却風の流れがラジエーターはもとより、フロント・リアのシリンダーバンクや排気システムに導かれ、熱気の排出を促進し、ライダーの居住性を向上させています。

効果的な冷却風のフローを作り、大きな冷却容量を確保するために、サイドカウルに大型のラジエーターダクトを設定しています。これは、車速が上がるとともに、ラジエーターダクトを通過する風の流れで負圧が発生し、これによってラジエーターを介し、空気をフロントホイール後部の高圧側のスペースから効果的に導入するものです。

　市街地走行等、エンジン冷却水の温度が上がった場合には、左ラジエーター表面に配置したサーモスタットの検知によって大型ファンを作動させ、強制空冷によってラジエーターを補助します。この場合、自動的にファンのスイッチが入り、冷えた空気をカウリング内部のスペースにダイレクトに取り込みます。